牛腺苷单磷酸脱氨酶(AMPD)家族基因编码蛋白的生物信息学分析
黄明捷,陈敏
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【摘要】腺苷—磷酸脱氨酶(Adenosine monophosphate deaminase,AMPD)作为嘌呤代谢过程中关键性的酶之一。为研 究牛腺苷单磷酸脱氨酶(AMPD)家族基因所编码蛋白的结构与功能,综合使用各类生物信息学软件开展生物信息学分析。 结果发现,牛 AMPD 家族基因由 747~799 氨基酸所编码,其亮氨酸(Leu)含量最高,色氨酸(Trp)含量最低,分子质量介 于 5.90~6.92ku,AMPD 蛋白均为疏水性蛋白;AMPD 家族蛋白中的 AMPD1 是稳定蛋白,而 AMPD2 和 AMPD3 是不稳定蛋白。 由 α- 螺旋、β- 转角以及无规卷曲是形成牛 AMPD 家族基因主要二级结构。牛 AMPD 蛋白亚细胞定位在细胞质、细胞核, 而 AMPD2 在内质网、细胞外基质等也有少量分布。
【关键词】AMPD 基因;肌苷酸(IMP);生物信息学分析
【中图分类号】S823 【文献标识码】A 【DOI】10.12325/j.issn.1672- 5336.2022.10.041
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